Ufuk Varyantları: Gama, Iota ve Mu’dan Dersler

2021’in başlarında, Kolombiya’daki bilim adamları endişe verici yeni bir koronavirüs varyantı keşfettiler. Sonunda Mu olarak bilinen bu varyant, uzmanların bağışıklık sisteminin savunmasından kaçmasına yardımcı olabileceğine inandığı birkaç rahatsız edici mutasyona sahipti.

Takip eden aylarda Mu, Kolombiya’da hızla yayıldı. Covid-19 vakalarında yeni bir artışa neden oluyor. Ağustos ayının sonunda düzinelerce ülkede tespit edilmişti ve Dünya Sağlık Örgütü bunu bir “ilgi çeşidi” olarak belirlemişti.

Nebraska Üniversitesi Tıp Merkezi’nden genomik epidemiyolog Joseph Fauver ve “Mu, küresel olarak biraz gürültü yapmaya başlamıştı” dedi. varyant üzerine yeni bir çalışma.

Ve sonra fışkırdı. Bugün, varyant tamamen ortadan kalktı.

Her Delta veya Omicron için yerel dalgalanmaları tetikleyen ancak asla küresel hakimiyete geçmeyen bir Gama, Iota veya Mu varyantları vardır. Uzmanlar, Omicron’u anlamak kritik bir halk sağlığı önceliği olmaya devam ederken, bu daha küçük soylardan öğrenilecek dersler olduğunu söylüyor.

California San Diego Üniversitesi’nden moleküler epidemiyolog Joel Wertheim, “Bu virüsün adapte olmayı ve gelişmeyi bırakmaya teşviki yok” dedi. Ve bunu geçmişte nasıl yaptığını görmek, gelecekte neler yapabileceğine hazırlanmamıza yardımcı olacak.”

Ayrıca-ranların çalışmaları, Amerika’nın uluslararası seyahat yasaklarının etkili olmadığına dair daha fazla kanıt sağlayarak, gözetim boşluklarına ve politika hatalarına ve virüsü neyin başarılı kıldığına ışık tuttu ve pandeminin erken evresinde bulaşıcılığın daha önemli olduğunu öne sürdü. bağışıklık kaçırmaktan daha iyidir.

Araştırma ayrıca bağlamın ne kadar önemli olduğunu da vurguluyor; bazı yerlerde etki yaratan varyantlar, diğerlerinde hiçbir zaman yer edinemez. Sonuç olarak, hangi varyantların baskın hale geleceğini tahmin etmek zordur ve gelecekteki varyantlar ve patojenler hakkında bilgi sahibi olmak kapsamlı, neredeyse gerçek zamanlı gözetim gerektirecektir.

Dr. Wertheim, “Viral genomik diziye bakarak ve ‘Bu muhtemelen diğerinden daha kötü’ diyerek çok şey kazanabiliriz” dedi. “Fakat gerçekten bilmenin tek yolu yayılmasını izlemek, çünkü hiçbir zaman tutunamayan bir sürü potansiyel olarak tehlikeli varyant var.”

İşte Mu’ya bakıyor

Koronavirüs sürekli değişiyor ve çoğu yeni varyant asla fark edilmiyor veya adlandırılmıyor. Ancak diğerleri, ya hızla daha yaygın hale geldikleri için ya da genomları uğursuz göründüğü için alarm veriyor.

Kolombiya’da yayılan Mu için her ikisi de doğruydu. Sidney Üniversitesi’nde genomik epidemiyolog ve yeni Mu gazetesinin yazarı Mary Petrone, “İnsanların çok yakından izlediği birkaç mutasyon içeriyordu” dedi. Spike proteinindeki mutasyonların birçoğu, Beta ve Gamma dahil olmak üzere diğer bağışıklıktan kaçan varyantlarda belgelenmiştir.

Henüz bilimsel bir dergide yayımlanmayan yeni çalışmada bilim insanları Mu’nun biyolojik özelliklerini Alfa, Beta, Delta, Gama ve orijinal virüsünkilerle karşılaştırdı. Dr. Fauver, Mu’nun diğer varyantlardan daha hızlı çoğalmadığını, ancak grubun en bağışıklıktan kaçan varyantı olduğunu ve antikorlara Omicron dışında bilinen herhangi bir varyanttan daha dirençli olduğunu söyledi.

Araştırmacılar, dünyanın her yerinden toplanan Mu örneklerinin genomik dizilerini analiz ederek, varyantın yayılmasını yeniden yapılandırdı. Mu’nun muhtemelen 2020’nin ortalarında Güney Amerika’da ortaya çıktığı sonucuna vardılar. Daha sonra tespit edilmeden önce aylarca dolaştı.

Güney Amerika’nın birçok yerindeki genomik sürveyansın “düzensiz ve eksik” olduğunu söyledi. Seattle’daki Fred Hutchinson Kanser Araştırma Merkezi’nde viral evrim uzmanı olan Jesse Bloom. “Bu bölgelerde daha iyi gözetleme olsaydı, Mu hakkında ne kadar endişeli olunacağına dair daha hızlı bir değerlendirme yapmak muhtemelen daha kolay olurdu.”

Mu, başka bir meydan okuma da sundu. Koronavirüs örneklerinde nadir görülen, çerçeve kayması mutasyonu olarak bilinen bir tür mutasyona sahipti. Bu tür mutasyonlar, Dr. Fauver dahil bilim adamları Mu dizilerini bilgisayara yüklemeye çalıştığında hata olarak işaretlendi. GISAIDyeni varyantları takip etmek için kullanılan uluslararası bir viral genom deposu.

Bu karmaşıklık, Mu dizilerinin herkese açık paylaşımında gecikmelere neden oldu. Araştırmacılar, bir hastadan bir virüs örneğinin toplanması ile GISAID’de kamuya açık hale getirilmesi arasında geçen sürenin Mu vakaları için Delta vakalarından daha uzun olduğunu buldu.

Dr. Fauver, “Genomun kendisi temelde yapay gözetim boşlukları yaratıyordu” dedi. “En azından bizim deneyimimize göre, normalde günler içinde çıkarmaya çalıştığımız veriyi haftalarca alamamamızla sonuçlandı.”

(GISAID’in kalite kontrol sistemleri önemlidir, araştırmacılar vurguladı ve veri havuzu sorunu çözdü.)

Bu gözetleme boşluklarını Mu’nun bağışıklıktan kaçınma yeteneğiyle birleştirin ve varyantı kalkışa hazır görünüyordu. Ama öyle olmadı. Bilim adamları, Mu’nun bunun yerine Güney ve Orta Amerika’dan diğer kıtalara yayıldığını ancak oraya vardığında geniş çapta yayılmadığını buldu. Dr. Petrone, “Bu, bu varyantın belki de Kuzey Amerika ve Avrupa popülasyonlarına beklediğimiz kadar uygun olmadığının bir göstergesiydi” dedi.

Bunun nedeni, Mu’nun kendisini daha da zorlu bir değişkenle rekabet halinde bulmasıydı: Delta. Delta, antikorlardan kaçma konusunda Mu kadar yetenekli değildi, ancak daha bulaşıcıydı. Dr. Bloom, “Sonunda Delta daha geniş bir alana yayıldı” dedi.

Doğru varyant, doğru zaman

Başarılı varyantları incelemek, hikayenin sadece yarısını anlatıyor. Dr. Petrone, “Baskın olmayan değişkenler bir bakıma negatif kontrollerdir” dedi. “Bize neyin işe yaramadığını söylüyorlar ve bunu yaparken, değişken uygunluk etrafındaki bilgi boşluklarını doldurmaya yardımcı oluyorlar.”

Delta, Mu’nun yanı sıra Beta, Gamma ve Lambda dahil olmak üzere bağışıklıktan kaçan çeşitli varyantları geride bıraktı. Bu model, bir varyantın virüsün yüksek oranda bulaşıcı bir versiyonunu geride bırakmasına izin vermek için tek başına bağışıklık kaçırmanın yeterli olmadığını veya en azından az sayıda insanın bağışıklığa sahip olduğu pandeminin erken evresinde olmadığını gösteriyor.

Ancak aşılar ve çoklu enfeksiyon dalgaları bağışıklık ortamını değiştirdi. Bilim adamları, Omicron’un bu kadar başarılı olmasının nedeninin muhtemelen bir parçası olan, yüksek düzeyde bağışıklıktan kaçınan bir varyantın artık daha fazla avantaja sahip olması gerektiğini söyledi.

Yakın tarihli bir başka çalışma, New York City’de bağışıklıktan kaçan Gamma’nın daha iyisini yapma eğilimindeydi Önceden var olan bağışıklığın daha yüksek olduğu mahallelerde, bazı durumlarda ilk Covid dalgasında sert bir şekilde vuruldukları için. Çalışmanın yazarı olan Dr. Wertheim, “Yeni bir varyantı bir boşlukta göremeyiz, çünkü ondan önce gelen tüm varyantların gölgesinde ortaya çıkıyor” dedi.

Gerçekten de, geçmişteki değişkenlerin çatışması, başarının büyük ölçüde bağlama bağlı olduğunu ortaya koymaktadır. Örneğin, Kasım 2020’de toplanan virüs örneklerinde ilk kez tespit edilen Iota varyantının doğum yeri New York olabilir. Dr. Petrone, “Ve böylece erken bir dayanak buldu” dedi. Daha bulaşıcı Alfa varyantı geldikten sonra bile, Iota sonunda kaybolmadan önce aylarca şehrin baskın varyantı olarak kaldı.

Ancak Ocak 2021’de hem Iota hem de Alpha’nın ortaya çıktığı Connecticut’ta işler farklı gelişti. “Alfa bir anda havalandı ve Iota’nın hiç şansı olmadı” dedi. iki bölgedeki varyantların bir çalışması.

Benzer bir model, Omicron’un çoklu soylarında zaten oynamaya başlıyor. Amerika Birleşik Devletleri’nde, ilk olarak New York’ta tanımlanan bir alt değişken olan BA.2.12.1, havalandıGüney Afrika’da ise BA.4 ve BA.5 yeni bir yükselişe öncülük ediyor.

British Columbia Üniversitesi’nde evrimsel bir biyolog olan Sarah Otto, bu, azalan varyantları incelemek için başka bir nedendir, dedi. Belirli bir zaman ve yer için zayıf bir şekilde eşleştirilen bir varyant, başka bir yerde ortaya çıkabilir. Gerçekten de Mu’nun talihsizliği, bunun çok erken ortaya çıkması olabilirdi. “Bu varyantı gerçekten destekleyecek bağışıklığa sahip yeterli sayıda insan olmayabilirdi.” dedi.

Ancak endişenin bir sonraki çeşidi, hiçbir zaman tam olarak tutunamayan, bağışıklıktan kaçan bir soyun soyundan gelebilir veya buna benzer bir şey olabilir, dedi.

Önceki değişkenlere bakmak, onları içermede neyin işe yarayıp yaramadığına dair fikir verebilir. Yeni Gama çalışması, uluslararası seyahat yasaklarının, en azından Amerika Birleşik Devletleri’nin uyguladığı şekliyle, bir varyantın küresel yayılmasını önleme olasılığının düşük olduğuna dair daha fazla kanıt sağlıyor.

Gama ilk olarak 2020’nin sonlarında Brezilya’da tanımlandı. O yılın Mayıs ayında, Amerika Birleşik Devletleri çoğu ABD vatandaşı olmayan vatandaşın Brezilya’dan ülkeye seyahat etmesini yasakladı, bu kısıtlama yürürlükte kaldı Kasım 2021’e kadar. Ancak Gama, Ocak 2021’de Amerika Birleşik Devletleri’nde tespit edildi ve kısa sürede düzinelerce eyalete yayıldı.

Gamma hiçbir zaman dünya çapında hakim duruma gelmediği için yayılmasını incelemek, seyahat yasaklarının etkinliğinin “daha ​​temiz” bir resmini sağladı. California San Diego Üniversitesi’nde moleküler epidemiyolog ve çalışmanın yazarı olan Tetyana Vasylyeva dedi. “Diyelim ki, Delta gibi değişkenleri incelemek söz konusu olduğunda – her yerde büyük bir salgına neden olan bir şey – bazen kalıp bulmak gerçekten zor, çünkü çok büyük ölçekte ve çok hızlı oluyor” dedi. .

Dr. Fauver, hızla değişen bir virüsle devam eden küresel bir sağlık acil durumunda geleceğe odaklanmak için anlaşılabilir bir dürtü olduğunu söyledi. Ve dünyanın dikkati Delta’ya ve ardından Omicron’a çevrildiğinde, o ve meslektaşları eski haber Mu’yu incelemeye devam edip etmeyeceklerini tartıştılar.

Dr. Fauver, “’Artık Mu’yu umursayan var mı?’ gibiydik” dedi. “Ancak, endişenin önceki varyantları hakkında sorular soran ve neler olduğuna geriye dönüp bakmaya çalışan yüksek kaliteli çalışmalara hala yer olduğunu düşünüyoruz.”